Altium žije Gen(omi)kou
Zveme vás na odborný seminář Altium žije Gen(omik)ou, věnovaný sdílení zkušeností s moderními genomickými technologiemi a jejich využitím v diagnostické i výzkumné praxi.
Program je zaměřen mimo jiné na praktické zkušenosti uživatelů s novým library prep systémem SureSelect MAX (SSEL MAX), exomovým řešením SureSelect Human All Exon V8 + NCV a využitím SSEL library prepu pro long-read sekvenování.
Součástí semináře budou také přednášky věnované bioinformatické analýze a interpretaci dat pomocí platforem VarSome, SeqOne a Varan, doplněné o zkušenosti z jejich využití v diagnostické i výzkumné praxi.
Závěrečná část programu nabídne pohled na inovativní technologie. Představíme prostorovou transkriptomiku STOMICs, která umožňuje studovat genovou expresi přímo v kontextu tkáně a otevírá nové možnosti výzkumu i biomarkerových studií.
Novinkou v naší nabídce je elektronické mapování genomu Nabsys. Jde o moderní a eketivní technologii pro vysoce přesnou analýzu struktury genomu.
Seminář je příležitostí k otevřené odborné diskusi, sdílení zkušeností mezi uživateli, aplikačními specialisty i zástupci výrobců (MGI, NabSys, Agilent) a k navázání nových mezilaboratorních spoluprací.
Těšíme se na setkání v inspirativním prostředí gotického kláštera Emauzy v Praze 2.
Program semináře ke stažení ZDE.
Program semináře:
8:20 Prohlídka kláštera 1. skupina
9:00 - 9:05 Zahájení
9:05 – 9:20 Vyšetření endokrinopatií kity Agilent na sekvenátoru T1+ s bioinformatikou SeqOne a Varan
Josef Včelák, Endokrinologický ústav
9:20 – 9:35 Využití SureSelect Human All Exon V8 + NCV V8+NCV v hematologii a interpretace dat ve Varsome Clinical
Lukáš Vacek, ÚHKT
9:35 - 9:50 Jak zkazit WES ještě před spuštěním pipeline
Jana Tajtlová, FTN
9:50 – 10:05 Přístupy v diagnostice hereditárních onemocnění: technologie a klinické aplikace
Markéta Gančarčíková, FNHK
10:05 – 10:20 Kávová přestávka
10:20 – 10:35 Spatial Landscapes: Whole-Transcriptome Mapping with Stereo-sequencing
Christoffer Rozenfeld, MGI
10:35 – 10:50 Molecular atlas of the Adarb1 deficient adult mouse brain
Valentina Lacovich Strašil, CEITEC
10:50 – 11:05 From Raw Data to Publication-Ready Insights: End-to-End Analytics for Stomics Users
Daniel Žucha, Carta Genum
11:05 – 12:05 Oběd
11:05 Prohlídka kláštera 2. skupina, oběd 1. a 3. skupina
11:35 Prohlídka kláštera 3. skupina, oběd 2. skupina
12:05 – 12:20 Next Generation Mapping: Unlocking the Architecture of the Human Genome with Electronic Genome Mapping
Dana Jaber, NabSys
12:20 – 12:35 Size Matters: choosing the right QC platform for your long reads sequencing
Ibrahim Bitar, FN a LF Plzeň
12:35 – 12:50 První zkušenosti s celoexomovým sekvenováním v rámci prenatálního vyšetření na přístroji DNBSEQ G99
František Liška, Genvia a 1. LF UK
12:50 - 13:05 CGP panel
FN Ostrava
13:05 – 13:20 Hybrid-capture NGS za hranicemi hotspotů: nekanonické fúze a varianty s nízkou alelickou frekvencí v diagnostických a prediktivních kazuistikách
Marie Trková, FN Motol
13:20 – 13:45 Kávová přestávka
13:45 – 14:00 VARAN očima diagnostické laboratoře: aneb od plenek k …
Monika Beránková, FNHK
14:00 – 14:15 Průvodce temnými zákoutími NGS aneb kostlivci v bioinformatické skříni
Tomáš Hron, Altium
14:15 – 14:30 What is the air-speed velocity of an unladen swallow? aneb molekulární biologie z ptačí perspektivy
Petr Lněnička, Altium
14:30 Zakončení semináře
