Frakcionace peptidů – BioSPE® Peptide Fractionation
Efektivní frakcionace peptidů pro hloubkovou proteomickou analýzu
BioSPE® Peptide Fractionation (PepFrac) představuje účinné řešení pro frakcionaci peptidových směsí, které umožňuje zvýšit počet identifikovaných proteinů při LC-MS/MS analýze komplexních biologických vzorků, jako je například krevní plazma. Technologie využívá separaci peptidů na základě jejich hydrofobicity při zásaditém pH, čímž významně snižuje komplexitu analyzovaných vzorků a zlepšuje možnosti hloubkové proteomické analýzy.
Frakcionace při zásaditém pH představuje ortogonální separační přístup vůči běžné reverzně-fázové kapalinové chromatografii používané při následné LC-MS/MS analýze. Díky odlišné selektivitě obou separačních kroků lze dosáhnout efektivnějšího rozdělení peptidů do jednotlivých frakcí, minimalizovat jejich překryv a zvýšit celkové pokrytí proteomu.
Použití BioSPE® Peptide Fractionation (PepFrac) může ve srovnání s nefrakcionovanými vzorky zvýšit počet identifikovaných proteinů až o 30 %. Metoda je vhodná pro kvalitativní i kvantitativní proteomické analýzy, zejména při práci se složitými biologickými matricemi a vzorky obsahujícími velké množství různých proteinů.
Vlastnosti
Hlavní výhody BioSPE® Peptide Fractionation
- Vyšší počet identifikovaných proteinů – zvýšení počtu idnetifikací proteinů až o 30 % oproti nefrakcionovaným vzorkům.
- Efektivní snížení komplexity vzorků – rozdělení peptidových směsí až do 8 frakcí pro detailnější proteomickou analýzu.
- Minimální překryv jednotlivých frakcí – optimalizovaná separace zajišťuje rovnoměrné rozložení peptidů mezi frakcemi.
- Ortogonální separační mechanismus – frakcionace při zásaditém pH doplňuje následnou RP LC-MS/MS analýzu.
- Bez nutnosti následného odsolování – na rozdíl od frakcionace pomocí solných roztoků nevyžaduje další odsolovací krok před LC-MS/MS analýzou.
- Široká nabídka formátů – StageTips, centrifugační kolonky, 96jamkové destičky a SPE cartridge pro různé objemy a počty vzorků.
- Dvě kapacitní varianty – možnost výběru podle množství zpracovávaných peptidů.
- Snadné skladování – produkty lze uchovávat v suchu při pokojové teplotě bez zvláštních skladovacích podmínek.
Charakteristika produktu a jeho využití
BioSPE® Peptide Fractionation (PepFrac)
Specializované řešení pro frakcionaci peptidů pomocí inovativního sorbentu na bázi reverzní fáze. Separace probíhá při zásaditém pH a využívá rozdílné hydrofobní vlastnosti jednotlivých peptidů.
Technologie umožňuje rozdělení komplexních peptidových směsí až do osmi frakcí, které lze následně samostatně analyzovat metodou LC-MS/MS. Tím dochází ke snížení složitosti jednotlivých frakcí, lepšímu rozlišení peptidů a zvýšení počtu identifikovaných proteinů.
Frakcionace je vhodná zejména pro analýzu biologických vzorků s vysokou komplexitou, kde může být identifikace méně zastoupených proteinů omezena přítomností vysoce abundantních složek.
Dostupné formáty a kapacity
Produkty BioSPE® Peptide Fractionation jsou dostupné v několika formátech, které umožňují přizpůsobit přípravu vzorků individuálním požadavkům laboratoře – od zpracování jednotlivých vzorků až po paralelní frakcionaci většího počtu vzorků.
Jednotlivé soupravy obsahují:
- Frakcionační kolonky s inovativním reverzně-fázovým sorbentem.
- Adaptéry a sběrné pomůcky pro centrifugaci a zachycení jednotlivých frakcí. Každá souprava obsahuje devět sběrných pomůcek – jednu pro kondicionaci, nanášení a promývání vzorku a osm pro sběr elučních frakcí.
- Podrobný pracovní protokol pro rychlou a efektivní frakcionaci peptidů až do osmi frakcí.
- Roztok triethylaminu (TEA) pro provedení frakcionačního postupu.
K dispozici jsou dvě kapacitní varianty podle množství zpracovávaných peptidů. Volba vhodného produktu závisí zejména na množství peptidů ve vzorku, objemu nanášeného roztoku, požadovaném elučním objemu a počtu současně zpracovávaných vzorků.
Technické informace – objemy a kapacity
Pro jednotlivé formáty BioSPE® Peptide Fractionation (PepFrac) jsou stanoveny odpovídající pracovní objemy pro nanášení vzorků a eluci peptidových frakcí.
Výběr správného formátu a kapacity umožňuje optimalizovat frakcionační postup s ohledem na charakter vzorku a požadavky následné LC-MS/MS analýzy.
Podrobné informace o nanášecích a elučních objemech a maximálních kapacitách jednotlivých produktů jsou uvedeny v technické dokumentaci výrobce.
Specifikace
Oblasti použití
Produkty BioSPE® Peptide Fractionation nacházejí uplatnění především v proteomických laboratořích, při hloubkové analýze proteomu, identifikaci proteinů v komplexních biologických matricích a kvantitativních proteomických studiích. Jsou vhodné zejména pro analýzu krevní plazmy, komplexních proteinových digestů a dalších biologických vzorků, u nichž je požadováno zvýšení počtu identifikovaných proteinů a rozšíření pokrytí proteomu.
Technologie představuje efektivní nástroj pro výzkumné aplikace vyžadující citlivou a reprodukovatelnou LC-MS/MS analýzu s důrazem na maximalizaci získaných proteomických informací.
Odsolování peptidů – BioSPE® Peptide Desalting
Efektivní čištění a odsolování peptidů pro proteomické analýzyBioSPE®...
Odstraňování magnetických částic – BioSPE® Magnetic Beads Removal
Efektivní odstranění magnetických částic při přípravě vzorků pro prote...
Obohacování glykopeptidů – BioSPE® Glycopeptide Enrichment
Efektivní čištění a obohacování glykopeptidů a glykanůBioSPE® Glycopep...
