MALBAC® Single Cell WGA Kit
Na základě patentované technologie MALBAC® může tato sada účinně generovat 2–5 µg gDNA během 4 hodin z jediné buňky nebo ekvivalentního množství gDNA v pikogramové úrovni.
Vlastnosti
Sada Yikon Genomics Single Cell Whole Genome Amplification Kit, založená na patentované technologii MALBAC®, dokáže efektivně generovat 2–5 μg gDNA.
z jedné buňky během 4 hodin nebo ekvivalentní množství gDNA na úrovni pikogramů. Míra úspěšnosti amplifikace této sady je přes 96 %, a to i pri amplifikaci v AT a GC bohatých oblastech.. Kit byl úspěšně použit jako součást preimplantačních genetických testů (PGT), při spracovavani onkologických, neurologických vzorků, vzorku kmenových bunek i metagenomu.
Specifikace
Provozní proces
Výhody
- Dobrá uniformita - Analýzu CNV lze provádět i pomocí mělkého sekvenování.
- Vysoké pokrytí - Ve více než 90 % genů v jednotlivých buňkách lze dosáhnout amplifikace.
- Nízká míra ztráty alel (allele dropout) - Vhodné pro analýzu SNP ve vzorcích z jednotlivých buněk.
- Stabilní produkt - Lze získat 2–5 µg produktu s délkou fragmentů 300–2000 bp.
- Vysoká citlivost - Lze použít jako templát pro vzácné vzorky, jako jsou jednotlivé buňky, jednotlivé chromozomy či velmi malé množství genomové DNA od 0,5 pg.
- Široké uplatnění - Technologie byla využita ve výzkumných oblastech, jako jsou onkologie, neurologie, reprodukce, kmenové buňky, mikrobiologie, archeologie a další.
Reference
[1]C. Zong, S.Lu, A.R. Chapman,X.S.Xie. Genome-Wide Detection of Single-Nucleotide and Copy Number Variations of a Single Human Cell.Science, 2012,338,1622-1626.
[2]Lu S, Zong C,Xie XS, et al.Probing Meiotic Recombination and Aneuploidy of Single Sperm Cells by Whole Genome Sequencing using MALBAC.Science,2012,338(6114):1627-30
[3]Huang J , Xu L , Tang F , et al. Genome Analyses of Single Human Oocytes[J]. Obstetrical and gynecological survey, 2014.
[4]Ni X. Zhuo M.Xie XS,et al. Reproducible Copy Number Variation Patterns among Sinale Circulating Tumor Cells ofLung Cancer Patients.PNAS,2013,110(52):21083-8.
[5]Yu Z , Lu S , Huang Y . Microfluidic Whole Genome Amplification Device for Single Cell Sequencing[J]. Analytical Chemistry, 2014, 86(19):9386-9390.
[6]Huang , Yan L, Xie XS, Oiao J, et al. Validation of Multiple Annealing and Looping-Based Amplifcation Cycle Sequencing
