Ekspresja genów

Rozwiązanie do badania ekspresji genów dowolnego organizmu za pomocą mikromacierzy oligonukleotydowych obejmuje zestawy odczynników do znakowania RNA, hybrydyzacji, płukania, system do skanowania mikromacierzy SureScanner oraz oprogramowanie do analizy statystycznej wyników Genespring.
Szeroki wybór mikromacierzy umożliwia:
- Badanie całego transkryptomu,
- Badanie alternatywnego splicingu.
Cechy
Protokół przygotowania próbki cechuje się prostotą wykonania i wymaga co najmniej 10 ng RNA. Badanie może być przeprowadzone w układzie jedno- lub dwukolorowym, w zależności od potrzeb badawczych. Jak pokazują publikacje z renomowanych ośrodków naukowych mikromacierze ekspresyjne mogą być stosowane równolegle z RNA-seq np. jako narzędzie umożliwiające badanie przesiewowe.
Kluczowym składnikiem platformy do analizy transkryptomu jest Genespring. Program ten umożliwia każdemu biologowi określenie poziomu ekspresji genów i miRNA, analizę szlaków metabolicznych oraz lokalizację białek w komórce. Dodatkowe moduły Genespring mogą posłużyć do analizy metabolitów oraz wyników z różnych technik wykorzystujących NGS. Dzięki temu możliwa jest kompleksowa analiza multiomiczna próbek.