Digital PCR
Digitalna PCR (dPCR) naprednija je i osetljivija verzija tradicionalne PCR metode. To je tehnika razvijena za precizno merenje broja specifičnih regija DNA ili RNA. dPCR omogućava veću osetljivost i specifičnost pri određivanju količine ciljane DNA.
Ključni značaj digitalne PCR tehnologije
- Kvantitativna osetljivost: dPCR omogućava precizno merenje broja specifičnih molekula DNA ili RNA, što omogućava detekciju retkih varijanti i niskih kopija.
- Visoka osetljivost i tačnost: dPCR povećava tačnost rezultata numeričkim izračunavanjem ciljanih molekula, što omogućava preciznu analizu genetskih varijacija, gena niske ekspresije i malih promena u DNA.
- Specifičnost: dPCR pruža nizak pozadinski signal i visoku specifičnost, što omogućava jasnu identifikaciju specifičnih regija ciljane DNA.
Proces digitalne PCR tehnologije
- Priprema uzorka: Uzorci DNA ili RNA pripremaju se za analizu ciljanih regija. Uzorak se obično deli na male regije ili mikroregije.
- Digitalna podela: Uzorak se meša s PCR smešom i deli u male kontejnere ili mikrokapljice za pojedinačne reakcije. Svaki kontejner deluje nzavisno tokom PCR procesa.
- PCR reakcija: Svaki kontejner prolazi kroz standardne PCR uslove, uključujući denaturaciju, prijanjanje i produženje. Ciljana regija DNA amplificira se u svakom delu nezavisno.
- Izračunavanje rezultata: Nakon PCR-a, utvrđuje se prisutnost ili odsutnost ciljane DNA u svakom delu. Broj pozitivnih reakcija koristi se za izračunavanje količine ciljane DNA, a podaci se obrađuju statističkim metodama.
Primene digitalne PCR tehnologije
- Genetička istraživanja: Osetljiva analiza genetskih varijacija, detekcija mutacija i merenje nivoa ekspresije gena.
- Medicinska dijagnostika: Testiranje genetskih predispozicija za rak, određivanje genetskih bolesti i praćenje terapija. Pogodno za specifične primene poput detekcije minimalne rezidualne bolesti (MRD).
- Analiza mikrobioma: Kvantifikacija i analiza raznolikosti mikroorganizama u životnoj sredini i ljudskim mikrobiomima.
- Forenzika: DNA profiliranje i osetljiva genetska analiza u kriminalističkim istragama.
- Životna sredina: Detekcija i kvantifikacija retkih DNA ciljeva u uzorcima životne sredine.
Digitalna PCR predstavlja snažan alat za osetljivu i preciznu kvantifikaciju DNA i RNA, s važnim primenama u različitim područjima, od genetskih istraživanja do kliničkih aplikacija.